Koko galaksi on kaaoksen kourissa. Tehtäväsi on Republic Commandos -eliittijoukon komentajana soluttautua, ottaa hallintaasi ja tuhota vihollinen. Joukkosi noudattaa käskyjäsi toimien yhdessä älykkäästi ja vaistonvaraisesti. Sinä johdat. He ovat aseesi.